esoilБюллетень Почвенного института имени В.В. ДокучаеваDokuchaev Soil Bulletin0136-16942312-4202V.V. Dokuchaev Soil Science Institute10.19047/0136-1694-2015-77-66-77esoil-270Research ArticleСтатьиПОЛНОПРОФИЛЬНЫЙ АНАЛИЗ МИКРОБИОМА ЦЕЛИННОГО СВЕТЛОГО СОЛОНЦА ДЖАНЫБЕКСКОГО СТАЦИОНАРАCOMPREHENSIVE ANALYSIS OF THE MICROBIOME IN THE COMPLETE PROFILE OF VIRGIN LIGHT-COLORED SOLONETZ SOIL AT THE TERRITORY OF DZHANYBEK EXPERIMENTAL STATIONЧерновТ. И.ChernovT. I.

119017, Москва, Пыжевский пер., 7, стр. 2 e-mail: chern-off@mail.ru

chern-off@mail.ruТхакаховаА. К.TkhakakhovaA. K.

119017, Москва, Пыжевский пер., 7, стр. 2

ЛебедеваМ. П.LebedevaM. P.

119017, Москва, Пыжевский пер., 7, стр. 2

КутоваяО. В.KutovayaO. V.

119017, Москва, Пыжевский пер., 7, стр. 2

Почвенный институт им. В.В. ДокучаеваРоссияV. V. Dokuchaev Soil Science InstituteRussian Federation2015010320150776677Copyright © Чернов Т.И., Тхакахова А.К., Лебедева М.П., Кутовая О.В., 20152015Чернов Т.И., Тхакахова А.К., Лебедева М.П., Кутовая О.В.Chernov T.I., Tkhakakhova A.K., Lebedeva M.P., Kutovaya O.V.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://bulletin.esoil.ru/jour/article/view/270

Проведено исследование структуры микробиома целинного светлого гидрометаморфизованного мелкого солонца с использовани-ем молекулярно-генетических (анализ прокариотного метагенома) и культуральных методов. Выявлена резкая дифференциация прокариотного разнообразия (по количеству OTU, индексу Шеннона и Chao1) по профилю. Отмечаются общие черты микробиомов солонцового горизонта и нижней части профиля (низкое биоразнообразие, доминирование некоторых представителей филума Proteobacteria). Необычно высокую (почти 20% сообщества) долю в надсолонцовом горизонте почвы занимают археи группы Thaumarchaeota.

Under study was the microbiome structure in virgin light-colored hydromorphized solonetz soil by using molecular-genetic and cultural methods. It was shown that the diversity of the microbial community is constantly decreasing down the soil profile being sharply declined in the solonetz horizon. Against the background of decreasing the biodiversity some groups of Proteobacteria are prevailed in the solonetz horizon and in the lower part of the profile. An unusually higher share of Crenarchaeota (almost 20% of the community) is observed in the topsoil.

солонцыметагеномпочвенные микроорганизмыпиросеквенирование16S рРНКArchaeaбиоразнообразиеsolonetz soilmetagenomesoil microorganismspyrosequencing16S рРНКbiodiversityReferencesАндронов Е.Е., Пинаев А.Г., Першина Е.В., Чижевская Е.П. Выделение ДНК из образцов почвы (методические указания). СПб: ВНИИСХМ РАСХН, 2011. 27 с.Андронов Е.Е., Пинаев А.Г., Першина Е.В., Чижевская Е.П. Выделение ДНК из образцов почвы (методические указания). СПб: ВНИИСХМ РАСХН, 2011. 27 с.Классификация и диагностика почв России. Смоленск: Ойкумена, 2004. 342 с. 3. Лебедева М.П., Конюшкова М.В. Временные изменения микропризнаков в целинных и мелиорированных солонцах Джаныбекского стационара // Почвоведение. 2011. № 7. С. 1–14Классификация и диагностика почв России. Смоленск: Ойкумена, 2004. 342 с. 3. Лебедева М.П., Конюшкова М.В. Временные изменения микропризнаков в целинных и мелиорированных солонцах Джаныбекского стационара // Почвоведение. 2011. № 7. С. 1–14Классификация и диагностика почв России. 2004. Ойкумена. 342 с.Классификация и диагностика почв России. 2004. Ойкумена. 342 с.Першина Е.В., Тамазян Г.С., Дольник А.С., Пинаев А.Г., Сергалиев Н.Х., Андронов Е.Е. Изучение структуры микробного сообщества засоленных почв с использованием высокопроизводительного секвенирования // Экологическая генетика. 2012. Т. Х. № 2. С. 31–38.Першина Е.В., Тамазян Г.С., Дольник А.С., Пинаев А.Г., Сергалиев Н.Х., Андронов Е.Е. Изучение структуры микробного сообщества засоленных почв с использованием высокопроизводительного секвенирования // Экологическая генетика. 2012. Т. Х. № 2. С. 31–38.Роде А.А., Польский М.Н. Почвы Джаныбекского стационара, их морфологическое строение, механический и химический состав и физические свойства // Тр. Почв. ин-та им. В.В. Докучаева. М.: Изд-во АН СССР, 1961. Т. 56. С. 3–214.Роде А.А., Польский М.Н. Почвы Джаныбекского стационара, их морфологическое строение, механический и химический состав и физические свойства // Тр. Почв. ин-та им. В.В. Докучаева. М.: Изд-во АН СССР, 1961. Т. 56. С. 3–214.Сапанов М.К. Синхронность изменения уровней Каспийского моря и грунтовых вод в Северном Прикаспии во второй половине XX в. // Известия РАН. Сер. географическая. 2007. № 5. С. 82–87.Сапанов М.К. Синхронность изменения уровней Каспийского моря и грунтовых вод в Северном Прикаспии во второй половине XX в. // Известия РАН. Сер. географическая. 2007. № 5. С. 82–87.Bates S., Berg-Lyons D., Caporaso J.G., Walters W. A., Knight R., Fierer N. Examining the global distribution of dominant archaeal populations in soil // ISME J. 2011. № 5. P. 908–917.Bates S., Berg-Lyons D., Caporaso J.G., Walters W. A., Knight R., Fierer N. Examining the global distribution of dominant archaeal populations in soil // ISME J. 2011. № 5. P. 908–917.Caporaso J.G., Kuczynski J., Stombaugh J. et al. QIIME allows analysis of high throughput community sequencing data // Nature methods. 2010. V. 7(5). P. 335–336.Caporaso J.G., Kuczynski J., Stombaugh J. et al. QIIME allows analysis of high throughput community sequencing data // Nature methods. 2010. V. 7(5). P. 335–336.Microbiology of extreme soils / Eds. Dion P., Nautiyal C.S. Berlin/Heidelberg: Springer, 2008. 369 p. 11. World Reference Base for Soil Resources. 2006, FAO, Rome. 128 р.Microbiology of extreme soils / Eds. Dion P., Nautiyal C.S. Berlin/Heidelberg: Springer, 2008. 369 p. 11. World Reference Base for Soil Resources. 2006, FAO, Rome. 128 р.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.