Молекулярно-биологическими методами проведено исследование структуры микробного сообщества в профиле темно-серой почвы Luvic Retic Greyzemic Phaeozem (Loamic), Московская область, Каширский район. Микроорганизмы играют ведущую роль в преобразовании органического вещества почвы, их основная масса сосредоточена в верхней части профиля. В связи с этим большинство почвенных микробиологических исследований проводится для верхних горизонтов. Однако изучение микробного сообщества нижней части профиля представляет не только теоретический, но и практический интерес в связи с возрастающей интенсивностью эрозионных процессов. Методом количественной полимеразной цепной реакции в реальном времени оценено количество ДНК бактерий, архей и микромицетов в горизонтах исследуемой почвы. Исследован материал кротовины, находившейся на глубине 80 см. Наибольшее количество ДНК бактерий и архей выявлено в верхнем гумусово-аккумулятивном горизонте (9.6 × 108 и 9 × 107 копий/г почвы соответственно). С увеличением глубины наблюдалось плавное снижение количества ДНК бактерий и архей, что связано с изменением физико-химических условий в почве. ДНК микромицетов распределялись по профилю равномерно (5.0-9.4 × 107 копий/г почвы). Показатели содержания ДНК разных групп микроорганизмов в материале кротовины были близки к нижним минеральным горизонтам. Это может быть объяснено инфильтрацией воды через кротовину с элюированием микроорганизмов в период переувлажнения почв. Определяющими факторами, влияющими на количество ДНК микроорганизмов, являются элементарные почвенные процессы: биогенно-аккумулятивный в верхних горизонтах, глинисто-иллювиальный и гумусово-иллювиальный в нижних горизонтах темно-серой почвы.
Molecular-biological methods permitted to study the structure of the microbial community in the profile of dark-gray soil (Luvic Retic Greyzemic Phaeozem) in Kashira district of the Moscow region. Microorganisms playing an important role in transformation of the soil organic matter are mainly concentrated in the topsoil and the major microbiological studies are related to this part of the soil profile. However, the study of the microbial community in the lower soil horizons is not only of theoretical but also practical interest in view of increasing the intensity of erosion processes. The method of quantitative polymerase chain reaction was used to estimate the DNA quantity of bacteria, archespores and micromycetes in horizons of the above soil. Under study was also the crotovina material at a depth of 80 cm. The highest DNA quantity of bacteria and archespores proved to be in the upper humus-accumulative horizon (9.6 × 108 and 9 × 107 copy/g of soil respectively). Their quantity was decreased downwards the profile, what is connected with changes in the physic-chemical conditions of soil. DNA of micromycetes was evenly distributed throughout the soil profile (5.4-9.4 × 107 copy/g). In the crotovina material the DNA content of different microorganisms groups was close to that in lower mineral soil horizons. This may be explained by water infiltration through the crotovina accompanying by eluviation of microorganisms in the period of soil wetting. The factors affecting the DNA amount of microorganisms are elementary soil processes including the biogenic-accumulative process in the upper soil horizons, clay-illuvial and humus-illuvial processes in the lower horizons of the dark-gray soil.
The authors declare that there are no conflicts of interest present.