Еsтiматiоn оf dnа quаnтiту in diffеrеnт grоuрs оf мiсrооrgаnisмs wiтнin gеnетiс ноrizоns оf тне dаrк-grау sоil

Molecular-biological methods permitted to study the structure of the microbial community in the profile of dark-gray soil (Luvic Retic Greyzemic Phaeozem) in Kashira district of the Moscow region. Microorganisms playing an important role in transformation of the soil organic matter are mainly concentrated in the topsoil and the major microbiological studies are related to this part of the soil profile. However, the study of the microbial community in the lower soil horizons is not only of theoretical but also practical interest in view of increasing the intensity of erosion processes. The method of quantitative polymerase chain reaction was used to estimate the DNA quantity of bacteria, archespores and micromycetes in horizons of the above soil. Under study was also the crotovina material at a depth of 80 cm. The highest DNA quantity of bacteria and archespores proved to be in the upper humus-accumulative horizon (9.6 × 10⁸ and 9 × 10⁷ copy/g of soil respectively). Their quantity was decreased downwards the profile, what is connected with changes in the physic-chemical conditions of soil. DNA of micromycetes was evenly distributed throughout the soil profile (5.4-9.4 × 10⁷ copy/g). In the crotovina material the DNA content of different microorganisms groups was close to that in lower mineral soil horizons. This may be explained by water infiltration through the crotovina accompanying by eluviation of microorganisms in the period of soil wetting. The factors affecting the DNA amount of microorganisms are elementary soil processes including the biogenic-accumulative process in the upper soil horizons, clay-illuvial and humus-illuvial processes in the lower horizons of the dark-gray soil.

ПЦР (полимеразная цепная реакция), профильное распределение микроорганизмов, бактерии, археи, микромицеты, Polymerase chain reaction, profile distribution of microorganisms, bacteria, micromycetes

1. Андронов Е.Е., Петрова С.Н., Пинаев А.Г., Першина Е.В., Рахимгалиева С.Ж., Ахмеденов К.М., Горобец А.В., Сергалиев Н.Х. Изучение структуры микробного сообщества почв разной степени засоленности с использованием T-RFLP и ПЦР с детекцией в реальном времени // Почвоведение. 2012. № 2. С. 173-183.

2. Андронов Е.Е., Пинаев А.Г., Першина Е.В., Чижевская Е.П. Выделение ДНК из образцов почвы (методические указания). СПб.: ВНИИСХМ РАСХН, 2011. 27 с.

3. Базыкина Г.С. Гидрологическая деградация автоморфных почв в агроландшафтах // Бюл. Почв. ин-та им. В.В. Докучаева. 2012. Вып. 70. С. 43-55.

4. Василенко Е.С., Кутовая О.В., Тхакахова А.К., Мартынов А.С. Изменение численности микроорганизмов в зависимости от величины агрегатов миграционно-мицелярного чернозема // Бюл. Почв. ин-та им. В.В. Докучаева. 2014. Вып. 73. С. 85-97.

5. Добровольский Г.В. Разнообразие генезиса и функций лесных почв // Почвоведение. 1993. № 9. С. 5-12.

6. Единый государственный реестр почвенных ресурсов России. Версия 1.0. Коллективная монография. М.: Почв. ин-т им. В.В. Докучаева, 2014. 768 с.

7. Классификация и диагностика почв России. Смоленск: Ойкумена, 2004. 342 с.

8. Манучарова Н.А. Молекулярно-биологические аспекты исследований в экологии и микробиологии. М. Изд-во Моск. ун-та, 2010. 47 с.

9. Полянская Л.М., Гейдебрехт В.В., Степанов A.Л., Звягинцев Д.Г. Распределение численности и биомассы микроорганизмов по профилям зональных типов почв // Почвоведение. 1995. № 3. С. 322-328.

10. Урусевская И.С., Соколова Т.А., Шоба С.А., Багнавец О.С., Куйбышева И.П. Морфологические и генетические особенности профиля светло-серой лесной почвы на покровных суглинках // Почвоведение. 1987. № 4. С. 5-16.

11. Agnelli A., Ascher J., Corti G., Ceccherini M.T., Nannipieri P. Distribution of microbial communities in a forest soil profile investigated by microbial biomass, soil respiration and DGGE of total and extracellular DNA // Soil Biol. Biochem. 2004. P. 859-868.

12. Baldrian P., Vetrovsky T., Cajthaml T., Dobiasova P., Petrankova M., Snajdr J., Eichlerova I. Estimation of fungal biomass in forest litter and soil // Fungal ecology. 2013. P. 1-11.

13. Fierer N., Schimela J.P., Holden P.A. Variations in microbial community composition through two soil depth profiles // Soil Biol. Biochem. 2003. P. 167-176.

14. Gangneux C., Akpa-Vinceslas M., Sauvage H., Desaire S., Houot S., Laval K. Fungal. bacterial and plant dsDNA contributions to soil total DNA extracted from silty soils under different farming practices: Relationships with chloroform-labile carbon // Soil Biol. Biochem. 2011. P. 431-437

15. IUSS Working Group WRB. World Reference Base for Soil Resources 2014. International soil classification system for naming soils and creating legends for soil maps. World Soil Resources Reports No. 106. FAO, Rome. 2014. 181 p.