ПОЛНОПРОФИЛЬНЫЙ АНАЛИЗ МИКРОБИОМА ЦЕЛИННОГО СВЕТЛОГО СОЛОНЦА ДЖАНЫБЕКСКОГО СТАЦИОНАРА
https://doi.org/10.19047/0136-1694-2015-77-66-77
Аннотация
Проведено исследование структуры микробиома целинного светлого гидрометаморфизованного мелкого солонца с использовани-ем молекулярно-генетических (анализ прокариотного метагенома) и культуральных методов. Выявлена резкая дифференциация прокариотного разнообразия (по количеству OTU, индексу Шеннона и Chao1) по профилю. Отмечаются общие черты микробиомов солонцового горизонта и нижней части профиля (низкое биоразнообразие, доминирование некоторых представителей филума Proteobacteria). Необычно высокую (почти 20% сообщества) долю в надсолонцовом горизонте почвы занимают археи группы Thaumarchaeota.
Ключевые слова
солонцы,
метагеном,
почвенные микроорганизмы,
пиросеквенирование,
16S рРНК,
Archaea,
биоразнообразие
Об авторах
Т. И. Чернов
Почвенный институт им. В.В. Докучаева
Россия
119017, Москва, Пыжевский пер., 7, стр. 2 e-mail: chern-off@mail.ru
Россия
119017, Москва, Пыжевский пер., 7, стр. 2 e-mail: chern-off@mail.ru
А. К. Тхакахова
Почвенный институт им. В.В. Докучаева
Россия
119017, Москва, Пыжевский пер., 7, стр. 2
Россия
119017, Москва, Пыжевский пер., 7, стр. 2
М. П. Лебедева
Почвенный институт им. В.В. Докучаева
Россия
119017, Москва, Пыжевский пер., 7, стр. 2
Россия
119017, Москва, Пыжевский пер., 7, стр. 2
О. В. Кутовая
Почвенный институт им. В.В. Докучаева
Россия
119017, Москва, Пыжевский пер., 7, стр. 2
Россия
119017, Москва, Пыжевский пер., 7, стр. 2
Список литературы
1. Андронов Е.Е., Пинаев А.Г., Першина Е.В., Чижевская Е.П. Выделение ДНК из образцов почвы (методические указания). СПб: ВНИИСХМ РАСХН, 2011. 27 с.
2. Классификация и диагностика почв России. Смоленск: Ойкумена, 2004. 342 с. 3. Лебедева М.П., Конюшкова М.В. Временные изменения микропризнаков в целинных и мелиорированных солонцах Джаныбекского стационара // Почвоведение. 2011. № 7. С. 1–14
3. Классификация и диагностика почв России. 2004. Ойкумена. 342 с.
4. Першина Е.В., Тамазян Г.С., Дольник А.С., Пинаев А.Г., Сергалиев Н.Х., Андронов Е.Е. Изучение структуры микробного сообщества засоленных почв с использованием высокопроизводительного секвенирования // Экологическая генетика. 2012. Т. Х. № 2. С. 31–38.
5. Роде А.А., Польский М.Н. Почвы Джаныбекского стационара, их морфологическое строение, механический и химический состав и физические свойства // Тр. Почв. ин-та им. В.В. Докучаева. М.: Изд-во АН СССР, 1961. Т. 56. С. 3–214.
6. Сапанов М.К. Синхронность изменения уровней Каспийского моря и грунтовых вод в Северном Прикаспии во второй половине XX в. // Известия РАН. Сер. географическая. 2007. № 5. С. 82–87.
7. Bates S., Berg-Lyons D., Caporaso J.G., Walters W. A., Knight R., Fierer N. Examining the global distribution of dominant archaeal populations in soil // ISME J. 2011. № 5. P. 908–917.
8. Caporaso J.G., Kuczynski J., Stombaugh J. et al. QIIME allows analysis of high throughput community sequencing data // Nature methods. 2010. V. 7(5). P. 335–336.
9. Microbiology of extreme soils / Eds. Dion P., Nautiyal C.S. Berlin/Heidelberg: Springer, 2008. 369 p. 11. World Reference Base for Soil Resources. 2006, FAO, Rome. 128 р.
Рецензия
Для цитирования:
Чернов Т.И., Тхакахова А.К., Лебедева М.П., Кутовая О.В. ПОЛНОПРОФИЛЬНЫЙ АНАЛИЗ МИКРОБИОМА ЦЕЛИННОГО СВЕТЛОГО СОЛОНЦА ДЖАНЫБЕКСКОГО СТАЦИОНАРА. Бюллетень Почвенного института имени В.В. Докучаева. 2015;(77):66-77. https://doi.org/10.19047/0136-1694-2015-77-66-77
For citation:
Chernov T.I., Tkhakakhova A.K., Lebedeva M.P., Kutovaya O.V. COMPREHENSIVE ANALYSIS OF THE MICROBIOME IN THE COMPLETE PROFILE OF VIRGIN LIGHT-COLORED SOLONETZ SOIL AT THE TERRITORY OF DZHANYBEK EXPERIMENTAL STATION. Dokuchaev Soil Bulletin. 2015;(77):66-77. https://doi.org/10.19047/0136-1694-2015-77-66-77
Просмотров: 522
Послать статью по эл. почте 
