COMPREHENSIVE ANALYSIS OF THE MICROBIOME IN THE COMPLETE PROFILE OF VIRGIN LIGHT-COLORED SOLONETZ SOIL AT THE TERRITORY OF DZHANYBEK EXPERIMENTAL STATION
https://doi.org/10.19047/0136-1694-2015-77-66-77
Abstract
Under study was the microbiome structure in virgin light-colored hydromorphized solonetz soil by using molecular-genetic and cultural methods. It was shown that the diversity of the microbial community is constantly decreasing down the soil profile being sharply declined in the solonetz horizon. Against the background of decreasing the biodiversity some groups of Proteobacteria are prevailed in the solonetz horizon and in the lower part of the profile. An unusually higher share of Crenarchaeota (almost 20% of the community) is observed in the topsoil.
About the Authors
T. I. Chernov
V. V. Dokuchaev Soil Science Institute
Russian Federation
Russian Federation
A. K. Tkhakakhova
V. V. Dokuchaev Soil Science Institute
Russian Federation
Russian Federation
M. P. Lebedeva
V. V. Dokuchaev Soil Science Institute
Russian Federation
Russian Federation
O. V. Kutovaya
V. V. Dokuchaev Soil Science Institute
Russian Federation
Russian Federation
References
1. Андронов Е.Е., Пинаев А.Г., Першина Е.В., Чижевская Е.П. Выделение ДНК из образцов почвы (методические указания). СПб: ВНИИСХМ РАСХН, 2011. 27 с.
2. Классификация и диагностика почв России. Смоленск: Ойкумена, 2004. 342 с. 3. Лебедева М.П., Конюшкова М.В. Временные изменения микропризнаков в целинных и мелиорированных солонцах Джаныбекского стационара // Почвоведение. 2011. № 7. С. 1–14
3. Классификация и диагностика почв России. 2004. Ойкумена. 342 с.
4. Першина Е.В., Тамазян Г.С., Дольник А.С., Пинаев А.Г., Сергалиев Н.Х., Андронов Е.Е. Изучение структуры микробного сообщества засоленных почв с использованием высокопроизводительного секвенирования // Экологическая генетика. 2012. Т. Х. № 2. С. 31–38.
5. Роде А.А., Польский М.Н. Почвы Джаныбекского стационара, их морфологическое строение, механический и химический состав и физические свойства // Тр. Почв. ин-та им. В.В. Докучаева. М.: Изд-во АН СССР, 1961. Т. 56. С. 3–214.
6. Сапанов М.К. Синхронность изменения уровней Каспийского моря и грунтовых вод в Северном Прикаспии во второй половине XX в. // Известия РАН. Сер. географическая. 2007. № 5. С. 82–87.
7. Bates S., Berg-Lyons D., Caporaso J.G., Walters W. A., Knight R., Fierer N. Examining the global distribution of dominant archaeal populations in soil // ISME J. 2011. № 5. P. 908–917.
8. Caporaso J.G., Kuczynski J., Stombaugh J. et al. QIIME allows analysis of high throughput community sequencing data // Nature methods. 2010. V. 7(5). P. 335–336.
9. Microbiology of extreme soils / Eds. Dion P., Nautiyal C.S. Berlin/Heidelberg: Springer, 2008. 369 p. 11. World Reference Base for Soil Resources. 2006, FAO, Rome. 128 р.
Review
For citations:
Chernov T.I., Tkhakakhova A.K., Lebedeva M.P., Kutovaya O.V. COMPREHENSIVE ANALYSIS OF THE MICROBIOME IN THE COMPLETE PROFILE OF VIRGIN LIGHT-COLORED SOLONETZ SOIL AT THE TERRITORY OF DZHANYBEK EXPERIMENTAL STATION. Dokuchaev Soil Bulletin. 2015;(77):66-77. https://doi.org/10.19047/0136-1694-2015-77-66-77
Views:
704
Email this article 
