Preview

Бюллетень Почвенного института имени В.В. Докучаева

Расширенный поиск

ПОЛНОПРОФИЛЬНЫЙ АНАЛИЗ МИКРОБИОМА ЦЕЛИННОГО СВЕТЛОГО СОЛОНЦА ДЖАНЫБЕКСКОГО СТАЦИОНАРА

https://doi.org/10.19047/0136-1694-2015-77-66-77

Полный текст:

Аннотация

Проведено исследование структуры микробиома целинного светлого гидрометаморфизованного мелкого солонца с использовани-ем молекулярно-генетических (анализ прокариотного метагенома) и культуральных методов. Выявлена резкая дифференциация прокариотного разнообразия (по количеству OTU, индексу Шеннона и Chao1) по профилю. Отмечаются общие черты микробиомов солонцового горизонта и нижней части профиля (низкое биоразнообразие, доминирование некоторых представителей филума Proteobacteria). Необычно высокую (почти 20% сообщества) долю в надсолонцовом горизонте почвы занимают археи группы Thaumarchaeota.

Об авторах

Т. И. Чернов
Почвенный институт им. В.В. Докучаева
Россия
119017, Москва, Пыжевский пер., 7, стр. 2 e-mail: chern-off@mail.ru


А. К. Тхакахова
Почвенный институт им. В.В. Докучаева
Россия
119017, Москва, Пыжевский пер., 7, стр. 2


М. П. Лебедева
Почвенный институт им. В.В. Докучаева
Россия
119017, Москва, Пыжевский пер., 7, стр. 2


О. В. Кутовая
Почвенный институт им. В.В. Докучаева
Россия
119017, Москва, Пыжевский пер., 7, стр. 2


Список литературы

1. Андронов Е.Е., Пинаев А.Г., Першина Е.В., Чижевская Е.П. Выделение ДНК из образцов почвы (методические указания). СПб: ВНИИСХМ РАСХН, 2011. 27 с.

2. Классификация и диагностика почв России. Смоленск: Ойкумена, 2004. 342 с. 3. Лебедева М.П., Конюшкова М.В. Временные изменения микропризнаков в целинных и мелиорированных солонцах Джаныбекского стационара // Почвоведение. 2011. № 7. С. 1–14

3. Классификация и диагностика почв России. 2004. Ойкумена. 342 с.

4. Першина Е.В., Тамазян Г.С., Дольник А.С., Пинаев А.Г., Сергалиев Н.Х., Андронов Е.Е. Изучение структуры микробного сообщества засоленных почв с использованием высокопроизводительного секвенирования // Экологическая генетика. 2012. Т. Х. № 2. С. 31–38.

5. Роде А.А., Польский М.Н. Почвы Джаныбекского стационара, их морфологическое строение, механический и химический состав и физические свойства // Тр. Почв. ин-та им. В.В. Докучаева. М.: Изд-во АН СССР, 1961. Т. 56. С. 3–214.

6. Сапанов М.К. Синхронность изменения уровней Каспийского моря и грунтовых вод в Северном Прикаспии во второй половине XX в. // Известия РАН. Сер. географическая. 2007. № 5. С. 82–87.

7. Bates S., Berg-Lyons D., Caporaso J.G., Walters W. A., Knight R., Fierer N. Examining the global distribution of dominant archaeal populations in soil // ISME J. 2011. № 5. P. 908–917.

8. Caporaso J.G., Kuczynski J., Stombaugh J. et al. QIIME allows analysis of high throughput community sequencing data // Nature methods. 2010. V. 7(5). P. 335–336.

9. Microbiology of extreme soils / Eds. Dion P., Nautiyal C.S. Berlin/Heidelberg: Springer, 2008. 369 p. 11. World Reference Base for Soil Resources. 2006, FAO, Rome. 128 р.


Для цитирования:


Чернов Т.И., Тхакахова А.К., Лебедева М.П., Кутовая О.В. ПОЛНОПРОФИЛЬНЫЙ АНАЛИЗ МИКРОБИОМА ЦЕЛИННОГО СВЕТЛОГО СОЛОНЦА ДЖАНЫБЕКСКОГО СТАЦИОНАРА. Бюллетень Почвенного института имени В.В. Докучаева. 2015;(77):66-77. https://doi.org/10.19047/0136-1694-2015-77-66-77

For citation:


Chernov T.I., Tkhakakhova A.K., Lebedeva M.P., Kutovaya O.V. COMPREHENSIVE ANALYSIS OF THE MICROBIOME IN THE COMPLETE PROFILE OF VIRGIN LIGHT-COLORED SOLONETZ SOIL AT THE TERRITORY OF DZHANYBEK EXPERIMENTAL STATION. Dokuchaev Soil Bulletin. 2015;(77):66-77. (In Russ.) https://doi.org/10.19047/0136-1694-2015-77-66-77

Просмотров: 45


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 0136-1694 (Print)
ISSN 2312-4202 (Online)